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这个立异的病原体"生命之树"提供了超过192个官方招供的物种的闲居信息,如它们的进化史和群体内的互干系系。此外,它还包括30多个非认真阐明的分类群。该器用纳入了来自每个物种基因组内多个位置的基因序列数据,以及每个物种的公共位置、它们的植物宿主以及病原体居住在宿主植物内或宿主植物上的位置等要津细节。
北卡罗来纳州立大学植物病理学William Neal Reynolds特聘考验Jean Ristaino说:"咱们正在行使我的共事Ignazio Carbone诞生的基于树的罗列汲取器(T-BAS)器用包,将扫数已知的植物病菌物种放入一个活的'生命之树'中,谈判东说念主员不错将新出现的阻止物种放入灵通的树中,并稽察哪些群体正在扩大和演变"。他是PLOS ONE上描绘该器用的论文的通信作家。
来自智利的马铃薯植株展示了由Phytophthora引起的晚疫病的影响。而已起头:Jean Ristaino,北卡罗来纳州立大学
这个新器用将使谈判东说念主员梗概及时更新植物疾病信息。
足交twitterRistaino说:"留心疾病爆发的真的要津是在疾病爆发之前收拢信号,T-BAS不错当作疾病监测和弄清可能出现的下一个新品系的器用。谈判东说念主员不错查询这个数据库,该树将纳入新的物种"。他是北卡罗来纳州新出现的植物疾病和公共食物安全集群的负责东说念主。
Phytophthora属的第一个物种,即"植物絮叨者",于1876年被描绘和定名。噬菌体存在于空气、泥土和水中,不错对食粮作物、不雅赏植物和树木形成疾病。
北卡罗来纳州的博士生Allison Coomber说:"自2000年以来,爽直有150种新的嗜酸菌被已然出来,他和团队沿路诞生了这个器用。"
"这是一个格外开阔的植物病原体物种数目,"Ristaino说。"很多Phytophthora物种具有闲居的宿主范畴,因此它们不错在更闲居的地区'出动'。"
Ristaino于2001年在《当然》杂志上发表了一篇论文,细目了形成爱尔兰马铃薯歉收的Phytophthora infestans菌株,他但愿最终能将物理舆图与T-BAS数据皆集起来,以匡助在各州或国度之间提供更好的病原体监测。
Ristaino说:"咱们仍是挖掘了扫数已发表的对于Phytophthora的数据。协作和共享数据比守神秘故兴味得多"。
Ristaino补充说,Phytophthora T-BAS器用被甩掉在DeCIFR采集流派中女同 sex,可通过北卡罗来纳州的玄虚真菌谈判中心得到,该中心探索真菌相称在农业、动物、环境和东说念主类健康系统中弘扬的作用。对于看望该器用的进一步信息不错在Ristaino现实室的网站上找到。