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这个革命的病原体"生命之树"提供了提升192个官方认同的物种的鄙俗信息,如它们的进化史和群体内的互关系系。此外,它还包括30多个非看重证据的分类群。该器用纳入了来自每个物种基因组内多个位置的基因序列数据,以及每个物种的群众位置、它们的植物宿主以及病原体居住在宿主植物内或宿主植物上的位置等要道细节。
北卡罗来纳州立大学植物病理学William Neal Reynolds特聘解释Jean Ristaino说:"咱们正在驾驭我的共事Ignazio Carbone设置的基于树的摆设选拔器(T-BAS)器用包,将扫数已知的植物病菌物种放入一个活的'生命之树'中,计划东谈主员不错将新出现的威迫物种放入敞开的树中,并稽查哪些群体正在扩大和演变"。他是PLOS ONE上花式该器用的论文的通信作家。
来自智利的马铃薯植株展示了由Phytophthora引起的晚疫病的影响。尊府着手:Jean Ristaino,北卡罗来纳州立大学
这个新器用将使计划东谈主员大概及时更新植物疾病信息。
Ristaino说:"预防疾病爆发的着实要道是在疾病爆发之前收拢信号,T-BAS不错四肢疾病监测和弄清可能出现的下一个新品系的器用。计划东谈主员不错查询这个数据库,该树将纳入新的物种"。他是北卡罗来纳州新出现的植物疾病和群众食物安全集群的负责东谈主。
Phytophthora属的第一个物种,即"植物松懈者",于1876年被花式和定名。噬菌体存在于空气、泥土和水中,不错对食粮作物、不雅赏植物和树木酿成疾病。
北卡罗来纳州的博士生Allison Coomber说:"自2000年以来,约莫有150种新的嗜酸菌被飞舞出来,他和团队全部设置了这个器用。"
"这是一个终点强大的植物病原体物种数目,"Ristaino说。"很多Phytophthora物种具有鄙俗的宿主界限,因此它们不错在更鄙俗的地区'挪动'。"
Ristaino于2001年在《当然》杂志上发表了一篇论文,细目了酿成爱尔兰马铃薯歉收的Phytophthora infestans菌株,他但愿最终能将物理舆图与T-BAS数据聚拢起来,以匡助在各州或国度之间提供更好的病原体监测。
Ristaino说:"咱们依然挖掘了扫数已发表的对于Phytophthora的数据。互助和共享数据比隐藏要故有趣得多"。
足交Ristaino补充说,Phytophthora T-BAS器用被甩掉在DeCIFR会聚学派中夜夜撸网站,可通过北卡罗来纳州的详细真菌计划中心获取,该中心探索真菌过火在农业、动物、环境和东谈主类健康系统中施展的作用。对于拜访该器用的进一步信息不错在Ristaino执行室的网站上找到。